As contaminações microbiológicas estão entre os principais fatores que provocam perdas no processo de produção de açúcar e etanol. A presença de contaminantes causa transtornos nas operações de extração, tratamento do caldo e fermentação. Bactérias consomem matéria-prima (sacarose) e afetam também os produtos finais.
Algumas bactérias são responsáveis também pelo surgimento de amido e dextrana que interferem no processo de produção de açúcar. A multiplicação de bactérias biodeterioradoras gera gases ácidos orgânicos, sendo o ácido lático considerado o principal deles. Com teor elevado na dorna, a bactéria lática provoca alguns transtornos no processo de fermentação: afeta a performance da levedura e ocasiona também a formação de flocos.
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